本片是《哈利·波特》系列电影的第一部，忠实地再现了原著小说的核心情节。故事始于年幼的哈利·波特被寄养在麻瓜亲戚德思礼一家，过着备受欺凌的生活。在他十一岁生日之际，他收到了来自霍格沃茨魔法学校的录取通知书，并从钥匙管理员鲁伯·海格口中得知了自己的巫师身世，以及他的父母是被邪恶的伏地魔杀害的真相。 在海格的带领下，哈利进入了巫师世界，在对角巷购买了学习用品。随后，他在九又四分之三站台登上了霍格沃茨特快列车，并在此结识了两位一生中最重要的朋友——罗恩·韦斯莱和赫敏·格兰杰。 进入霍格沃茨后，三人被分院帽分入了格兰芬多学院。他们开始了奇妙的魔法课程学习，同时也与来自斯莱特林学院的德拉科·马尔福结下梁子。不久，他们发现学校三楼的禁区内藏着一个神秘的物品——魔法石，并怀疑为人苛刻的魔药课教授西弗勒斯·斯内普企图将其盗走。 为了阻止阴谋，三人组冲破了重重魔法关卡，包括三头犬路威、魔鬼网、飞天钥匙和巨型巫师棋。最终，哈利独自面对真正的窃贼——黑魔法防御术教授奇洛。原来，伏地魔的残存灵魂一直寄生在奇洛的后脑勺上。在厄里斯魔镜前，哈利凭借纯洁的内心获得了魔法石。由于身上存有母亲莉莉·波特牺牲时留下的古老护身符，哈利的触碰对奇洛和伏地魔是致命的。最终，哈利成功保护了魔法石，伏地魔的灵魂则再次逃逸。学期末，格兰芬多因哈利等人的英勇行为赢得了学院杯。
尽管本片以其对原著的高度忠实而闻名，但出于时长和节奏的考虑，仍存在一些显著的改编和删减。