日本魔法省是负责管理日本巫师社会、执行魔法法律的最高权力机构。如同英国的魔法部一样，其首要职责之一是维护《国际巫师联合会保密法》，确保魔法世界对非魔法人士（麻瓜）的隐藏。 关于该机构的详细信息，如其内部结构、具体位置和建筑风格，在现有资料中均未被提及。日本魔法省与该国唯一的魔法学校 马法尔图 (Mahoutokoro) 之间存在着密切的合作关系，共同处理教育、法律及安全等事务。所有关于日本魔法省的信息均来源于 J.K. 罗琳在 Pottermore 网站上发布的补充材料，在七本核心小说中并未被提及。(Pottermore)
日本魔法省在《哈利・波特》系列原著小说中没有任何作用，也从未被提及。 它的存在完全建立在扩展宇宙的背景设定中。其最显著的一次间接“出场”是在 2014 年 魁地奇世界杯 的相关报道中（由 J.K. 罗琳为 Pottermore 撰写）。在该届世界杯上，日本国家队在与斐济队的比赛中遭遇惨败，这起事件很可能需要日本魔法省介入处理，以应对国际影响和维持国内魔法界的秩序。(Pottermore)
关于日本魔法省内部的任何具体部门或区域，目前完全未知。