神奇动物保护管理司是魔法部内规模最大、结构最复杂的部门之一,其核心职能是根据魔法生物的危险性对其进行分类、管理和控制。该部门依据《神奇动物在哪里》一书中的危险等级分类系统(从 X 级到 XXXXX 级)来开展工作。 该司下设三个核心分支:兽类司、精怪司和灵魂司,这三大分支分别负责不同类型的生物。
除了这三大核心分支,该司还设有多个办公室和委员会,以处理特定物种或特定问题。
神奇动物保护管理司在系列故事中扮演了重要的背景和情节推动角色。