神奇動物管理控制司是魔法部规模最大的司局之一,其办公区位于魔法部的第四层。根据《哈利·波特与火焰杯》中的描述,该层的走廊略显破旧,墙壁上挂着一些画框歪斜的神奇动物图片。各个办公室的门风格迥异,有的门上带有抓痕,有的门上则有钥匙孔。 该司的内部结构复杂,根据其管理对象和职能,下设了三个主要分司:兽类司 (Beast Division)、人类司 (Being Division) 和灵魂司 (Spirit Division)。这三大分司的划分基于魔法部对“生物”的官方定义,该定义本身在巫师世界中充满了争议。除了这三大核心分司外,还设有多个联络办公室和委员会,以处理与特定智慧种族或特定事务相关的问题。
该司在整个系列故事中扮演了重要角色,常常成为推动情节或反映巫师社会偏见的关键背景。