神奇生物办公室是魔法部最重要的部门之一，其办公区域位于魔法部总部的第二层，与禁止滥用魔法办公室共享此楼层。该部门的根本使命是处理巫师世界中与各类神奇生物相关的所有事务，维护巫师与神奇生物之间的平衡与秩序，并向非魔法世界（Muggle world）隐瞒神奇生物的存在。 该部门的历史悠久，其内部结构复杂，反映了巫师社会对不同生物的认知和态度。其核心职能之一是对所有已知的生物进行分类。最著名的分类标准是将生物划分为“生物”（Beast）、“存在”（Being）和“灵魂”（Spirit），这一定义自 1811 年由时任魔法部长的格罗根・斯坦普提出后沿用至今，并直接促成了该部门三大主要司处的建立：生物司、存在司和灵魂司。 在历史上，该部门的政策深受当权者和公众舆论的影响。例如，在多洛雷斯·乌姆里奇掌权期间，她极力推动了一系列歧视性的反狼人和反马人法规，这严重恶化了魔法部与这些种族的关系。
神奇生物办公室在《哈利・波特》系列故事中扮演了关键的背景和情节推动角色。
神奇生物办公室是一个庞大的机构，其下设有多个职能各异的司、处和委员会：