第二次巫师战争是巫师世界在 20 世纪末期爆发的一场大规模、高烈度的全球性冲突。这场战争的核心对抗双方，一方是由重生的伏地魔领导的食死徒及其盟友，另一方则是由阿不思·邓布利多重建的凤凰社、霍格沃茨的师生以及后来由哈利·波特领导的抵抗力量。战争从 1995 年 伏地魔 的正式回归开始，直至 1998 年 5 月 2 日的霍格沃茨大战结束，以伏地魔的最终败亡告终。这场战争的特点是，在初期阶段表现为秘密渗透与恐怖活动，后期则演变为对魔法部的颠覆和公开的全面战争。
战争的根源可追溯至第一次巫师战争的结局。1981 年，伏地魔在试图杀害年幼的哈利·波特时，因莉莉·波特的牺牲咒而意外被自己的阿瓦达索命咒反弹，导致其肉身被毁。然而，通过事先制造的多个魂器，伏地魔的灵魂得以幸存。 战争的直接导火索是 1995 年 6 月 24 日，在三强争霸赛的结尾，小矮星彼得在小汉格顿的墓地利用古老的黑魔法仪式，使伏地魔成功复活并恢复了完整的肉身。 尽管伏地魔已经回归，时任魔法部部长的康奈利·福吉却出于对权力的恐惧和逃避现实的心态，拒绝承认这一事实。他领导下的魔法部发动了一场声势浩大的宣传运动，将哈利·波特和阿不思·邓布利多污蔑为骗子和疯子。这种官方的否认态度，为伏地魔及其追随者在暗中集结力量、招募盟友（如巨人和摄魂怪）提供了宝贵的时间和掩护，使得战争初期的力量对比对抵抗方极为不利。
第二次巫师战争的进程大致可分为三个主要阶段：
在霍格沃茨大战中，纳威·隆巴顿用戈德里克·格兰芬多的宝剑摧毁了伏地魔最后一个魂器——宠物蛇纳吉尼。最终，哈利·波特作为老魔杖的真正主人，使伏地魔的阿瓦达索命咒再次反弹到其自身，彻底杀死了他。 战争的结束带来了深远的影响：
“第二次巫师战争”这一名称是巫师历史学家们为了与伏地魔在 1970 年至 1981 年间发动的第一次恐怖统治——即“第一次巫师战争”——相区别而命名的。这种命名方式借鉴了麻瓜世界中对“第一次世界大战”和“第二次世界大战”的划分，意在强调这两场战争的关联性、规模以及对整个社会的巨大冲击。