霍格沃茨校董会是监督霍格沃茨运作的最高权力机构，理论上独立于魔法部，但其决策时常受到后者的影响。其核心职责包括：
霍格沃茨校董会在系列故事中扮演了关键但通常是幕后的角色，其行动深刻影响了霍格沃茨的领导层和稳定性。 在《哈利・波特与密室》中 校董会在这一学年中的活动最为突出。在蛇怪袭击事件接连发生后，时任校董会主席的卢修斯・马尔福利用其他校董对家人安全的担忧，胁迫他们共同签署了对校长阿不思・邓布利多的停职令。他声称邓布利多在处理危机上已无能为力。 在哈利・波特于密室中击败蛇怪并揭露汤姆・里德尔的日记的真相后，邓布利多得以复职。其余十一位校董意识到被卢修斯・马尔福所操纵，并威胁说如果他不辞去主席职务，他们就会揭露他胁迫众人的行径。因此，卢修斯・马尔福被极不光彩地解除了校董职务。 在《哈利・波特与凤凰社》中 在这一时期，魔法部部长康奈利・福吉为削弱邓布利多在魔法界的影响力并加强对霍格沃茨的控制，通过了一系列教育令。其中，《第二十四号教育令》赋予了魔法部指派的“霍格沃茨高级调查官”凌驾于校董会之上的权力。这使得由魔法部安插的多洛雷斯・乌姆里奇能够取代邓布利多成为校长，完全绕过了校董会的正常程序。这表明，在魔法部强力干预下，校董会的权力是有限的。