神奇动物管理控制司是魔法部最大的司局之一,其内部结构根据神奇动物的官方分类划分为三个主要分支:兽类司、生物司和灵魂司。这个分类本身在巫师社会中存在争议,其定义主要来源于纽特·斯卡曼德所著的《神奇动物在哪里》一书:“凡是能充分理解我国法律,并能在法律的制定过程中分担部分责任的生物,均可被定义为‘生物’(Being)”。
该司局下设多个专门的办公室和委员会,以处理具体的事务:
该司局在系列故事中多次出现,通常反映了魔法部的官僚主义、偏见以及在压力下的无能。