影片开始时，魔法世界正笼罩在伏地魔崛起的阴影之下。哈利·波特、罗恩·韦斯莱和赫敏·格兰杰决定放弃在霍格沃茨的最后一年学业，转而执行阿不思·邓布利多留下的遗命：寻找并摧毁伏地魔的魂器。 随着魔法部的垮台和食死徒势力的渗透，三人被迫踏上逃亡之路。在比尔·韦斯莱与芙蓉·德拉库尔的婚礼上，他们遭到食死徒的袭击，惊险逃脱后，开始在英国各地流浪。他们成功潜入由多洛雷斯·乌姆里奇控制的魔法部，并夺取了作为斯莱特林挂坠盒的魂器。 然而，摧毁魂器的困难以及其邪恶力量对佩戴者的负面影响，使得三人组内部产生了巨大的矛盾。罗恩·韦斯莱因感到被忽视和嫉妒而与哈利决裂并暂时离队。哈利与赫敏继续旅程，前往戈德里克山谷寻找线索，却在那里遭到伏地魔的宠物蛇纳吉尼的伏击，哈利的魔杖在此过程中被意外折断。 在绝望之际，罗恩在熄灯器的指引下回归，并使用格兰芬多宝剑摧毁了挂坠盒魂器，拯救了险些溺水的哈利。为了解开一个反复出现的神秘符号的谜团，三人拜访了谢诺菲留斯·洛夫古德，并首次听说了关于死亡圣器——长老魔杖、复活石和隐形衣——的传说。 不久后，他们不幸被“搜捕队”抓获，并被带到马尔福庄园。在那里，赫敏·格兰杰遭到了贝拉特里克斯·莱斯特兰奇的残酷折磨。最终，家养小精灵多比出现并成功营救了众人，但在幻影移形的最后时刻，多比被贝拉特里克斯掷出的匕首击中，不幸牺牲。影片的结尾，伏地魔找到了阿不思·邓布利多的坟墓，并从其手中夺走了传说中的长老魔杖。