本片故事发生在第一部电影事件的几个月后。强大的黑巫师 盖勒特·格林德沃 在从美国魔法国会 (MACUSA) 的押送中戏剧性地逃脱，并开始在欧洲集结信徒。他的最终目标是实现纯血统巫师对所有非魔法人士（麻鸡）的统治。 为了阻止他的计划，年轻的阿不思·邓布利多 招募了他曾经的学生——神奇动物学家纽特·斯卡曼德。纽特同意提供帮助，但并未意识到前方的危险。他与朋友雅各布·科瓦尔斯基、蒂娜·戈德斯坦恩和奎妮·戈德斯坦恩重逢，一同踏上了前往巴黎的旅程。然而，随着格林德沃势力的不断扩大，巫师世界内部分裂日益严重，就连最亲密的家人与朋友之间的爱与忠诚也面临着前所未有的考验。