「ホグワーツの謎」とは、ホグワーツ魔法魔術学校の城とその敷地内に存在する、数多くの秘密、隠された部屋、そして不可解な魔法現象の総称です。これらの謎は、約千年前の創設期にまで遡ります。 城の創設者であるゴドリック・グリフィンドール、ヘルガ・ハッフルパフ、ロウェナ・レイブンクロー、そしてサラザール・スリザリンは、当時マグルからの迫害が激化していたことを受け、城に強力な防御魔法と数々の秘密を組み込みました。最も有名なのは、サラザール・スリザリンが自身の後継者のために作った秘密の部屋です。創設者たちは、城が単なる教育機関ではなく、魔法界の若者たちを守る要塞となることを意図していました。 城の魔法は固定的ではなく、まるで生きているかのように振る舞います。大階段の行き先が気まぐれに変わったり、特定の条件でしか現れない部屋が存在したりと、城自体が生徒たちに試練を与え、同時に助けを与える存在となっています。いたずら仕掛けの地図の存在は、ジェームズ・ポッターたちのような才能ある生徒たちが、城の謎を解き明かし、さらには自ら新たな秘密（地図自体）を付け加えることさえ可能であったことを示しています。
ホグワーツの謎は、『ハリー・ポッター』シリーズ全体の物語を推進する上で極めて重要な役割を果たしています。
このように、ホグワーツの謎を解き明かす過程は、主人公たちの成長、友情の深化、そして善と悪の戦いと密接に結びついています。
ホグワーツ城内に存在する、特に重要ないくつかの謎めいたエリアは以下の通りです。